探员蒋浩华（甄子丹 饰）因办案手段凌厉大胆常受上峰批判，最近接到外派义务，赴菲律宾接回证人苏权，由于苏权一案牵涉蒋浩华杀妻仇人狄克（张耀扬 饰），蒋浩华枕戈待旦，但还是被狄克抢得先机班师不利的蒋浩华决议孤身滞留菲律宾，与外地探员艾度协作查案狄克是菲律宾颇有权利的卡先生之得力助手，近几年狄克借各种违法买卖中饱私囊，逐渐末尾应战卡先生位置。蒋浩华依线索调查狄克与卡先生团伙，不料惹起对方连串报复，菲律宾

线人缩骨谢在大马新奇被杀重案组神探黄维邦因手患不能持枪，本已方案离任，但曾受缩骨谢救命之恩，遂决意接手此案，且不怕把婚期押后，誓要擒得真凶黄维邦联同大马督察翁振富、老差骨金沙展及新扎师兄伦国强组成专案小組，依据线索向疑凶富商贺加年着手侦查，但数次举动皆无所获。反而被人姗姗来迟，暗将另一重要证人灭口，同时发现集团举动正受微妙人物监视。

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大内库藏武功秘笈《葵花宝典》失窃。东厂主管太监古今福（刘洵 饰）率千户欧阳全（张学友 饰）等，南下调查辞官锦衣卫林镇南，同时收用“五岳盟主”左冷禅（元华 饰）外围策应。华山派大弟子令狐冲（许冠杰 饰）与师妹岳灵珊（叶童 饰）奉师命增援林镇南，无奈两人实力不济，领得林镇南遗嘱后遁走，二人于路先后巧遇顺风堂堂主刘正风（午马 饰）、日月神教长老曲洋（林正英 饰）、华山派风清扬，获传《笑傲江湖》曲谱和独孤