在1999年，一艘外星宇宙战舰坠落到了地球，人们用了了十年的时间修复并取名为"MACROSS"2009年，MACROSS要塞正在举行一场偶像歌星林明美（饭岛真理 配音）的演唱会，突然空袭警报响起，要塞末尾了变形战役中，一条辉（长谷有洋 配音）驾驶着变形战役救下一名少女，战机却由于速渡过快撞进外层舱室。安宁后，辉发现救得是林明美。俩人相识后，为使明美快乐，辉偷开教练机带着明美去兜

西元1999年，一顆不明的庞大「流星」墜落在地球上之後調查證實這其實是一艘外星人的宇宙船，之後世界的某些強國為了將其修復並彌補墜落時對地球環境所构成的破壞（還得掩蓋掉這個外星船墜落的事實），而組成了統合政府並由地球統合軍將其改构成為全長1200公尺的超大型主力戰艦，命名為「馬克羅斯」（MACROSS，德文「大宇宙」之意）。其間人類卻也歷經統合派與反統合派國家陣營的分裂，在綿延的爭戰中馬克羅斯的改修