微妙组织·GOD看中了神敬太郎博士的人类工学技术，逼迫其参与，教授拒绝而遭袭击，儿子神敬介也被杀害，身受重伤的父亲为了让儿子复生，不顾自己的伤势，亲身执刀为儿子中止改造手术敬介醒来后，父亲已死，透过计算机留言，敬介了解GOD欲危害世界的阴谋，于是背负起统一罪恶的责任，成为第五号的假面骑士·假面骑士X