惊人的事实曝光后，Chandler舰长和他的团队在巴尔的摩知晓了这个国度的命运，以及他们自己的命运。虽然他们遭遇了严重迂回，但他们还是决议与一个地下抵抗组织结合起来击败所谓的总统Amy Granderson（她命令马里兰州警控制了内森-詹姆斯号和病毒的原始样本，她还决议只用解药治疗「有用之人」，从而树立一个「完美的社会」）。解药的剂量曾经很少，依然被囚禁在Avocet的Rachel试图尽其所能为患

悠远的黑暗世纪，柯文诺斯的子孙一分为二。血族在维多（比利·奈伊 Bill Nighy 饰）的指导下独天下，弱小的吸血兵团压制极具传染性且无法退化成人的残酷狼族。直到某天，一个神奇的生命降生，改动了这两个家族的命运。一只母狼诞下有着人类外表的狼人路西安（麦克·辛 Michael Sheen 饰），维多窥见狼人身体内的弱小实力，于是对其少量繁衍，并将狼人纳为效劳血族的奴隶。

职业杀手杰克·卡特不时在纽约独闯江湖,与自己住在洛杉矶的弟弟很少交往。后来因要列席弟弟葬礼而重返家园,他在深感内疚的同时,很快就感到弟弟的死另有隐情,经过调查,发现不少和弟弟有关系的人都有可疑,包美丽的弟媳妇,她的女儿,弟弟的老板,一个奥秘的女人,一个百万富翁等,最终凶手伏法,而卡特也为此付出了自己的生命。

在享用一个难得的假期之后，Scott（Sullivan Stapleton）和Stonebridge（Philip Winchester）被召回20分部接受新的义务另一名20分部特工在黎巴嫩贝鲁特追踪一目了然的恐惧分子al-Zuhari不幸丧命，Scott和Stonebridge必需查清事情的真相。一条新线索引导他们离开哥伦比亚的偏远丛林——拒信al-Zuhari的一个盟友正潜藏在这片由权利庞大&

TNT在推特发布正式确定《The Last Ship》第二季将于2015年6月21日 星期日在TNT回归  　　《末日孤舰》第二季将有13集，比第一季多了三集