U. C.0097时期，“拉普拉斯事故”的纷争终结后，2架独角兽高达被秘密封印，新吉翁残党“袖章”也随之瓦解就在人类逐渐走出战争带来的阴影之时，失踪两年的独角兽三号机“凤凰”突然现身，拥有推翻世界次第力气的它即刻引发了地球联邦军、吉翁袖章残党以及路欧商会三方权益的争夺狩猎，一场宇宙对决也行将拉开帷幕......