故事讲述的是空白兄妹诞生的6000年前，和兄妹两非常相似的里克,休比的故事

故事以只需女功用运用的世界最強兵器「Infinite Stratos（IS）」為中心，在女尊男卑的世界中，主角「織斑一夏」雖然身為男生卻能夠操縱 IS，為此他被強制進入培育 IS 操縱者的學校「IS 學園」，周圍理所當然也都是女性，而女生們也對這位「世上独一能夠运用 IS 的男性」感到興趣，就此展開了許多兴味橫生的學校生活

声優の花澤香菜さんのライブで花澤さんが『IS＜ｲﾝﾌｨﾆｯﾄ･ｽﾄﾗﾄｽ＞ 2期やります（決まりました）』