故事的舞台是互联网系统兴旺的都市「DEN CITY」。 　　在那里有经由巨型企业「SOL技术社」经过高度的网络技术构筑成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了应用决斗来停止黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目的是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”消灭。