为了救神谷薰（武井咲 饰），绯村剑心（佐藤健 饰）纵身跃入大海，清醒中他飘到某座小岛，最终为教授了他飞天御剑流的师父比古清十郎（福山雅治 饰）所救深感到自身与志志雄真实（藤原龙也 饰）的庞大差距，为了援救全日本，剑心恳请徒弟教授他飞天御剑流的最高奥义与此同时，志志雄剑指东京，迈出武力夺国的下一步。他强迫伊藤博文（小泽征悦 饰）对刽子手拔刀斋发布全国通缉令，得知音讯的薰、左之助（青木高尚 饰）则匆匆