21世纪末，人类的科技水平已高度兴旺，克隆人技术和宇宙飞行早已完成，不再是梦想。与此同时，许多迷信家仍孜孜不倦追索着人类来源的秘密与真相。经过对许多新鲜文明的调查与对比，迷信家伊丽莎白·肖（Noomi Rapac 饰）和查理·赫洛维（Logan Marshall-Green 饰）发现，人类能够是来自一个悠远星系的外星人发明的。在Weyland公司资助下，他们乘坐维克丝（查理兹·塞隆 Charlize Theron 饰）所掌管的宇宙飞船普罗米修斯号前往那颗未知的星球。 

经过对外地的调查，地球人的想象成功失掉印证。可是他们贸然探查“神的秘密”的行为，也将自己引入万劫不复的深渊……