谁也不曾想过，七十年前那期微妙的罗斯威尔事情，时至昔日仍对全体人类发作着如此庞大的影响并且鲜少有人窥见真相的全貌，即使它就在那里某天，过着颓丧生活的前联邦探员福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）以及他最为信任的同伴——正在某某教会医院担任医师的丹娜·斯科莉（吉莲·安德森 Gillian Anderson 饰）重新聚在一同。原来一档旨在揭露政治黑幕节目的掌管人找到他们，希望

美国FBI探员福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）童年时曾阅历一同新奇奥秘的绑架案，他的妹妹萨曼莎在睡梦中被外星人劫持，至今下落不明。从此穆德便专注于奥秘事情的研讨，并专门担任FBI总部的X档案部门。因穆德行事乖张，难以驾驭。FBI高层从联邦调查局学院调来女性探员黛娜·斯科莉（吉莲·安德森 Gillian Anderson 饰），外表上是协助穆德任务，实践上是希望这崇尚迷